Мал эмнэлгийн сургууль нь ХААИС-ийн стратеги төлөвлөлтийн дагуу оюутан төвтэй судалгааны их сургууль болох зорилтын хүрээнд доорхи гадаад дотоодын их, дээд сургууль, коллеж, мэргэжлийн байгууллагатай хамтын ажиллаж байна.

Гадаад хамтын ажиллагаатай байгууллагууд

• Швейцарийн хөгжлийн агентлаг (SDC) ОУ-ын байгууллага, 2010 оноос,
• Японы JICA ОУ-ын байгууллага, 2012 оноос,
• БНСУ-ын KOIKA ОУ-ын байгууллага, 2013 оноос,
• ОХУ-ын Буриадын ХАА-н академийн Мал эмнэлгийн факультет, 1997 оноос,
• ОХУ, Красноярскийн ХААИС, 2002 оноос,
• БНСУ, Chonbuk -ын үндэсний их сургуулийн Мал эмнэлгийн коллеж, 2007 оноос,
• Япон, Хоккайдогийн сургууль, 2012 оноос,
• БНХАУ-ын Жилиний их сургууль, 2010 оноос,
• Бүх хятадын ХААИС, 2011 оноос,
• Япон, Обихирогийн ХАА, мал эмнэлгийн их сургууль, 2013 оноос, 
• БНСУ, Чежү-ийн үндэсний их сургуулийн Мал эмнэлгийн коллеж, 2014 оноос,
• ОХУ, Новосибирскийн ХААИС, 2014 оноос,
• Вьетнам, Thai nguyen  их сургуулийн Мал эмнэлэг, МАА-н сургууль, 2015 оноос,
• БНХАУ, Shenyang ХААИС-ийн Мал эмнэлэг, МАА-н сургууль, 2016 оноос,
• БНСУ, Кonkuk их сургуулийн Мал эмнэлгийн коллеж, 2016 оноос,
• ОХУ, Эрхүүгийн ХААИС, 2017 оноос,
• БНХАУ-ын ӨМӨЗО-ны  Шилийн гол аймгийн Ажил мэргэжлийн дээд сургууль, 2017 оноос,
• БНХАУ, Тайваны Чунг Шин их сургуулийн Мал эмнэлгийн сургууль, 2017 оноос,
• Япон, Окояамагийн Шинжлэх ухааны их сургуулийн Мал эмнэлгийн сургууль, 2018 оноос,
• БНХАУ-ын ӨМӨЗО-ны  ХААИС-ийн Мал эмнэлгийн коллеж, 2019 оноос,
• Япон, “Чиёода” ХХК, “Маш мах” ХХК-тай хийсэн гурвалсан гэрээний хүрээнд 2019 оноос,
• БНСУ-ийн ХХАА-н яамны Хөдөөгийн хөгжлийн корпораци (KRC), 2019 оноос.